後來，兩人撕破臉，爾淳怒駡玉瑩假情假意。細想之後才發現，當時是玉瑩先提出義結金蘭，但逃跑時，玉瑩蹲在原地，卻不叫爾淳一起蹲下。劇情沒有對此事多做說明，玉瑩為什麼這麼做，都留給觀眾解讀。
沅琪被淑寧陷害致死，爾淳傷心難過，毒死淑寧給她報仇，事後為懲罰自己，甘願服食寒食散。爾淳很壞，但她對從小一起長大的淑寧、沅琪，又是真心實意的好。玉瑩後期，為了對付爾淳，利用孫白楊對她的愛，故意設計陷害孫白楊和爾淳偷情。
爾淳和玉瑩，誰都不是簡單角色，她們只是立場不同，劇情卻沒有強行給任何人洗白，只是將她們的一生展現給觀眾。
《甄嬛傳》裡的女人，為了情愛爭奪皇帝的寵愛，更像是一部以皇帝為核心的男人戲。 而《金枝欲孽》，是一群女人為自己的利益、地位，去爭搶、去互相陷害，甚至可以利用愛情、放棄愛情。爾淳為了義父的地位，事事算計，多虧孫白楊的幫助，爾淳才能多次化險為夷。
不知不覺中，爾淳愛上了這個風流倜儻太醫。可孫白楊卻將玉瑩的窘境，全都看在眼裡，記在心上。他愛上了潑辣的玉瑩，卻只能親手將心愛的女人送上皇帝的龍床。玉瑩為了母親在家的地位，必須爭寵，即使愛著孫白楊，也只能算計他，陷害他和爾淳偷情。
安茜愛著侍衛孔武，可她必須要做後宮最得寵的女人，才能為親人報仇，所以放棄和孔武在一起的機會。
權勢最盛的如妃，也曾有過天真之時，她為了自保，不得不爭鬥，搶奪。當她期待的良人，出現在她眼前，她也寧願放棄自己，成全孔武，讓他和安茜在一起。孔武一生鑽營，當他好不容易放棄權勢時，如妃卻走不出紫禁城，安茜也死在了他懷裡。
《金枝欲孽》中的愛情，是最不值錢，卻又最奢侈的東西。孫白楊說：在這皇城裡，真是半點由不得自己，深以為然。 劇中的每個人，都有自己的立場、動機，沒有單純的好人，也沒有單純的壞人。就連劇中的每個小人物，也都有自己的無可奈何。大家都為了自己想要的東西，去爭奪，遺憾的是，最後所有人都是求而不得。
玉瑩渴望尊嚴，最終卻為尊嚴而死；爾淳渴求愛，卻再無能愛之人；安茜渴望自由，卻在無數次最接近自由的時候，黯然收場。
最後一集，安茜身邊有愛人，卻堪堪將死；爾淳愛人已近，卻得到了安茜渴望的自由。所以，安茜對爾淳說： 「如妃做不到的事，她希望我可以做到，而我做不到的事，我希望你可以做到。」 後宮如囚籠，埋葬了女子的一生；人生如囚籠，我們又能去向何方？
只有求而不得，最終了了。悲劇，是《金枝欲孽》的底色，而結局處，緩緩離開紫禁城的馬車，成了劇作本身，對我們每個人的悲憫。 從悲劇到悲憫，這就是《金枝欲孽》的格局。
